Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms