Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf653Q6YND2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms