Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms