Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms