Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RimklaQ6PFX8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RimklaQ6PFX8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms