Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mfsd4aQ6PDC8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms