Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms