Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC061212Q6P8K3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms