Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms