Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SphkapQ6NSW3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms