Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms