Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mvb12bQ6KAU4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mvb12bQ6KAU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms