Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms