Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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