Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScapQ6GQT6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms