Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Tmcc1Q69ZZ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmcc1Q69ZZ6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms