Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk13Q69ZA1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms