Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms