Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf4Q64310 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms