Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PatjQ63ZW7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PatjQ63ZW7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PatjQ63ZW7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PatjQ63ZW7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PatjQ63ZW7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.7 ms