Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms