Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf260Q62513 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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