Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms