Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lcn3Q62471 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn3Q62471 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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