Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sp4Q62445 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms