Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt6hQ62383 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt6hQ62383 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms