Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SnrpaQ62189 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms