Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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