Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms