Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms