Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snta1Q61234 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms