Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms