Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik1Q60934 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms