Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms