Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcf4Q60722 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcf4Q60722 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms