Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SkiQ60698 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms