Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms