Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms