Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc11Q5U458 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms