Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms