Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms