Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms