Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms