Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf5Q5EBH1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms