Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms