Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox3aQ4TU90 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms