Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc27a5Q4LDG0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc27a5Q4LDG0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc27a5Q4LDG0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Slc27a5Q4LDG0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a5Q4LDG0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Slc27a5Q4LDG0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Slc27a5Q4LDG0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc27a5Q4LDG0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc27a5Q4LDG0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc27a5Q4LDG0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a5Q4LDG0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms