Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms