Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brinp3Q499E0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms