Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms